Está integrado por las especializaciones médicas, los cursos de posgrado de alta especialización en medicina, los programas de maestría y doctorado y las actividades de educación continua.
Acerca de las especializaciones médicas, existen 78 programas que son avalados por la Facultad de Medicina. En el 2018 se llevaron a cabo 674 cursos en 156 sedes hospitalarias. La matrícula de alumnos fue de 11,093 alumnos. 81 cursos contaron con pertenencia al padrón del Programa Nacional de Posgrados de Calidad del CONACyT.
Los Cursos de Posgrado de Alta Especialidad en Medicina (CPAEM) registraron una matrícula de 1,394 alumnos, inscritos en 366 diferentes programas, generándose un total de 648 cursos.